As categorias de base do futebol de salão do Paraná Clube são geridas pela parceira terceirizada A.A.F. (Associação dos Amigos do Futsal). O projeto, liderado por Marcos Mathias, conta com a formação de atletas que ao longo da evolução passarão pelas categorias juniores e serão encaminhados para a fase transitória no campo natural, para posteriormente serem direcionados para a vitrine na base do profissional.